序列对准工具简介 - 在线视频教程手表

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2014年12月11日 离开 经过 行政

序列对齐工具简介 - 视频教程

密歇根州立大学Candice Hansey博士概述了NCBI,包括如何获得序列和使用爆炸。此外,Hansey博士还提供了使用Exonerate,Mummer,FastX-Toolkit和Tuxedo Suite(包括Botwtie和Tophat)的示威。
网络研讨会的内容:
NCBI获得序列
使用爆炸进行序列对齐
使用其他用于专用序列对准的程序(Exerate EST和CDNA对准)
妈咪–全基因组对齐,Nucmer–Contigs或基因组的对准,Promer-设计用于使用六帧翻译的DNA对准的物种的对准太发散
vmatch - 短序列对齐–探针,引物和SNP
下一个环球序列对齐程序(Tuxedo Suite-Bowtie,Tophat,袖扣)